ساختار سازمانی شرکت خسرو مدیسا طب از نوع بخشی بوده و بر این اساس از پنج بخش معظم تجهیزات پزشکی، دندانپزشکی، تجهیزات آزمایشگاهی، دارویی و سلامت خانواده تشکیل یافته است. بخش تجهیزات پزشکی شرکت دارای پنج دپارتمان تخصصی تجهیزات بیمارستانی، حوادث غیرمترقبه، پوست و زیبایی، چشم پزشکی و قلب و عروق می باشد.
فعالیت کلیه بخش های تخصصی شرکت توسط واحدهای مجرب ستادی شامل بخشهای اداری، بازرگانی، مالی و فنی پشتیبانی می شود. همچنین هر یک از این بخش های تخصصی با بهره گیری از پزشکان و متخصصین مرتبط و مهندسان فعال و خبره ، مشتریان میانی و نهایی را در هر یک از حیطه های فنی و مشاوره ای یاری مینمایند.
